Computational Biology II

Papiere der AG

2013-04-12T11:38:54+02:00

Papiere der AG

Auf dieser Seite werden die Veröffentlichungen der Arbeitsgruppe zum Download angeboten.

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eaa_beweistechniken

2012-10-18T08:48:53+02:00

Beweistechniken (WS 12/13)

Die Veranstaltung Beweistechniken ist ein Bestandteil des Moduls Entwurf und Analyse von Algorithmen für Angewandte Informatiker, die dazu beitragen soll, die Vorkenntnisse verschiedener Hörergruppen im Bereich der Mathematik, insbesondere dem Beweisen, anzugleichen.

Beweistechniken wird dieses Semester von Sebastian Wild betreut.

Aktuelles

Der Abgabezeitraum für Blatt 6 wird bis Montag, 3.12, 12:00 Uhr verlängert.
Errata Blatt 5: In Aufgabe 18 soll überall m statt p stehen.

Termine

Beweistechniken findet stets Freitags 08:15 Uhr in Raum 42/110 statt.

Die ersten beiden Termine (19. und 26. Oktober) bestehen aus einer Vorlesung. Ab dann (erstmals am 2. November) wird Dominique Ufer in einer Saalübung die Abgaben zu den Übungsblättern besprechen.

Übungsblätter

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Aus den Abgaben müssen auf jedem Blatt 50% der Pflichtpunkte erreicht werden. Bewertet wird die sinnvolle Bearbeitung der Aufgaben. Durch freiwillige Aufgaben können Sie zusätzliche Punkte bekommen.

Adb II_Übungen

2012-10-02T13:49:07+02:00

Die Übungen zur Vorlesung finden alle zwei Wochen jeweils am Donnerstag ab 13:45 Uhr im Raum 48-654 statt. Erster Übungstermin ist der 1. November.

Übungsblätter

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AdB II_Aktuelles

2012-10-02T13:47:53+02:00

Die Übung vom 10.01.13 wird um eine Woche auf Do, 17.01.13 verschoben. Die Abgabefrist für Blatt 6 wird bis Mo, 14.01. verlängert.
Aufgrund des Feiertags wird die erste Übung vom 1.11. auf Di 30.10 15:30 Uhr vorverlegt.
Wer da keine Zeit hat, möge einfach bei Sebastian vorbeikommen.
Die erste Übung findet Donnerstag, 1. November, 13:45 Uhr in 48-654 statt.
Das erste Übungsblatt ist online:
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AdB II_Termine

2012-10-02T13:47:18+02:00

Im Wintersemester 2012/13 findet die Vorlesung wöchentlich von 10:00 bis 11:30 im Raum 48-654 statt.

MaLiJAn

2012-09-28T07:54:14+02:00

MaLiJAn

Maximum Likelihood Java Bytecode Analyzer

MaLiJAn is a tool implementation of Maximum Likelihood Analysis introduced in Maximum Likelihood Analysis of Algorithms and Data Structures. It allows automatic average case analyses of Java Bytecode programs with arbitrary input distributions. The generated results may be in terms of abstract cost measures like number of comparisons in sorting algorithms (provided by the user through code annotations), or the exact number of executed bytecode instructions.

To try MaLiJAn out, simply download the client application below, extract the tar archive to some folder and run java -jar malijan-client.jar. For parts of the computations, MaLiJAn uses a Mathematica server backend hosted on our servers, so you will need internet access.

The example project shows an analysis of a classic Quicksort implementation in the random permutation model. There, MaLiJAn reproduces the expected numbers of swaps and comparisons known from the literature. It also determines the expected number of executed bytecode instructions to be roughly 18 n ln(n).

Contact

If you encounter any problems or you have suggestions relating to MaLiJAn please feel free to write an email to Sebastian Wild.

Downloads

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References

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Login

2012-08-31T10:31:17+02:00

Benutzer-Anmeldung

Mathe-Tools

2012-08-28T14:56:36+02:00

Shortest Superstring

2012-08-28T14:49:19+02:00

Paarweise Alignments

2012-08-28T14:18:25+02:00